《吉林大学学报(医学版)》（双月刊）创刊于1959年，是中华人民共和国教育部主管、吉林大学主办的综合性医药卫生类学术期刊。

《吉林大学学报(医学版)》设有基础研究、临床研究、临床医学、影像学、调查研究、技术交流、综述、短篇及个案报道等栏目，全年刊发约300篇文章（不包括短篇报道），其中省级以上基金资助项目论文占80％以上。在基金资助项目中国家重点科技攻关项目、国家863计划项目、973计划项目及国家自然科学基金项目占很大比例。近年逐渐增加了校外优秀论文的刊发数量。在发展过程中不断提高办刊质量，先后被评为中国综合性医药卫生类核心期刊、中国科技核心期刊、中国生物医学核心期刊、吉林省一级期刊。收录《吉林大学学报（医学版）》的文摘刊物和数据库：《中国科学引文数据库》《中国学术期刊综合评价数据库》《万方数据库》《中国核心期刊（遴选）数据库》《中国期刊网》《中国学术期刊（光盘版）》《中国生物医学期刊文献数据库》《中国生物文献数据库》《中文生物医学期刊文献数据库》《中国药学文摘》《中文科技资料目录》《全国报刊索引》《电子科学文摘》、台湾《中文电子期刊服务》、美国《化学文摘》和俄罗斯《文摘杂志》等。

《吉林大学学报(医学版)》被北大1992版核心期刊、北大1996版核心期刊、北大2000版核心期刊、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊，剑桥科学文摘社ProQeust数据库、《动物学记录》收录。