《云南中医学院学报》（双月刊）创刊于1978年3月，为中国科技核心期刊,是由云南中医学院主办的公开发行的综合性中医药学术期刊，是我省较早公开出版发行的高校学报之一。主要反映我院及全国中医药科研、医疗、教学等方面的新成果、新信息，并突出中医药学术特色。

《云南中医学院学报》2009年，第二、三届云南期刊优秀栏目奖； 2006年首届中国高校特色科技期刊奖； 2004年教育部科技司优秀编辑出版质量奖； 1995年中医药管理局优秀期刊二等奖； 1995年国家教委科技司优秀学报三等奖等。