《沈阳医学院学报》创刊于1987年，1999年公开出版发行。是省级医药卫生类综合性学术期刊。辟有专家论坛、基础医学、临床医学、预防医学、临床护理、技术方法、大学生科技园地等栏目。作为反映学院教学和科研成果的学术期刊，在发表学术成果、促进学术交流、推动科学发展、培养后备人才、传播先进科技和积累科学史料等方面发挥了重要作用。目前，《沈阳医学院学报》已被《中国学术期刊网》、《中国学术期刊（光盘版）》、《万方数据-数字化期刊群》、《中华首席医学网》等国内6家权威数据库收录；

2002年在《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范》执行评优活动中，主要规范数据达到标准要求，荣获《CAJ-CD规范》执行优秀奖；2003年被《中国学术期刊数据库（CJFD)》全文收录并成为《中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）》统计刊源期刊；2004年编辑部被辽宁省科技厅授予辽宁省科技期刊“优秀编辑部”；2006年《沈阳医学院学报》荣获“沈阳市第四届优秀期刊”评选一等奖；2010年被中国核心期刊（遴选）数据库收录。2008年、2009年“专家论坛”栏目均被辽宁省新闻出版局评为科技期刊“优秀栏目一等奖”，其栏目作品多次获得优秀栏目作品一、二等奖。2009年、2010年学报封面被沈阳市新闻出版局评为“科技期刊封面设计一等奖”。